VRoman нам всем посоветовал:
Очень простой способ освободить место на диске без удаления всей очереди. Всего-навсего надо произвести поиск следующих файлов в папке structs при выключеном клиенте и удалить их: *.map; *.fld; *.xyz; *.out; *.pdbqs Мне это освободило 200 мег за несколько секунд. Эти файлы нужны только во время расчёта, и если клиент был остановлен, то эти файлы остаются на диске в виде хлама. А когда клиент начинает расчитывать кандидат за который он уже конгда-то брался, то он всё равно начинает всё с нуля и попросту перезаписывает эти файлы при повторном расчёте.
Свободных вам мегабайт на диске!